A商品はヤマトから、B商品はアマゾンから出荷という処理をしたいのですが、可能でしょうか?

A商品はヤマトから、B商品はアマゾンから出荷という処理をしたいのですが、可能でしょうか?

A商品とB商品が分割されるように設定することで、伝票を分割することが可能です。
必要であれば、A商品購入伝票の配送方法をヤマトに指定することもできます。